Снижение вирусной нагрузки по данным назофарингеальных соскобов во время последней фазы пандемии COVID-19 в госпитале Северного университета Италии
Тип: Статья
Специальность: Инфекционные болезни, Лабораторная диагностика
Автор: Nicola Clementi et al.
Опубликовано: De Gruyter, 29.06.2020
Перевод: Серафима Кокорина, Фонд профилактики рака
Аннотация
Цели
Во время последней фазы пандемии в Италии отмечалось более мягкое течение тяжелого острого респираторного синдрома, вызванного коронавирусом-2 (SARS-CoV-2). Этому могли способствовать несколько факторов, в том числе: эффект блокировки, социальная дистанция, снижение влажности и загрязнения воздуха, а также возможные изменения патогенности вируса. В этом отношении тяжесть течения COVID-19 может быть ослаблена мутациями в геноме SARS-CoV, которые уменьшили его вирулентность, а также снижением вирусного инокулята.
Методы
В этом пилотном исследовании мы сравнивали с помощью ПЦР с обратной транскрипцией профиль амплификации 100 мазков, полученных в апреле по время пика эпидемии SARS-CoV-2, и 100 мазков, собранных таким же образом в мае.
Результаты
Среднее значение порогового цикла (Ct) положительных образцов, полученных в мае, было значительно выше, чем в образцах, полученных в предыдущий период (ORF 1a/b ген: 31.85 ± 0.32 против 28.37 ± 0.5, p<0.001; E ген: 33.76 ± 0.38 против 29.79 ± 0.63, p<0.001), что предполагает снижение вирусной нагрузки во время сбора образцов. Не было обнаружено значимых различий между мужчинами и женщинами, в то время как более высокая вирусная нагрузка была обнаружена у пациентов старше 60 лет и у пациентов с тяжелым течением на ранних этапах пандемии.
Выводы
Данное пилотное исследование свидетельствует о необходимости дальнейшего изучения корреляции между вирусной нагрузкой SARS-CoV-2 и различными клиническими проявлениями COVID-19 в разные фазы пандемии. При молекулярной диагностике инфекции SARS-CoV-2 лабораториям следует рассмотреть возможность представления количественных данных о вирусной нагрузке.