Первый CRISPR-тест на коронавирус, одобренный в США

Оригинал: nature.com

Автор:Giorgia Guglielmi

Опубиковано: 08.05.2020 (www.nature.com)

Перевод: Яна Белышева, Фонд профилактики рака

Этот набор был одобрен для использования в чрезвычайных ситуациях и должен помочь уменьшить очереди на тестирование.

закрыть меню

УвеличитьОригинал

Американское Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (Food and Drug Administration, FDA) выдало первое разрешение на использование в экстренных ситуациях нового теста на коронавирус, основанного на технологии CRISPR.

Полномочия FDA позволяют ему в чрезвычайных ситуациях предоставлять доступ к тестам и лекарствам быстрее, чем обычно. Новый диагностический набор основан на подходе, разработанном первооткрывателем в области CRISPR Фэн Чжаном в Институте Броудов МТИ и Гарвардского университета (Кембридж, Массачусетс). Он будет использоватьсяв сертифицированных лабораториях для тестирования на новый коронавирус SARS-CoV-2.

Хотя, по данным некоммерческой организации The COVID Tracking Project, в конце апреля — начале маяв США стали делать в среднем почти 250 000 тестов в день, их хватает не везде. По словам Митчелла О’Коннелла, биохимика из Университета Рочестера в Нью-Йорке (в разработке теста он не участвовал), широкое использование нового набора, одобренного FDA, может улучшить эту ситуацию. Однако еще предстоит оценить, насколько хорошо набор работает в реальных условиях — например, в больницах, — по сравнению со стандартными тестами.

Диагностический набор на основе CRISPR был разработан компанией Sherlock Biosciences, также базирующейся в Кембридже. Он программирует механизм CRISPR, способный проникать в определенные генетические последовательности, на поиск фрагментов генетического материала SARS-CoV-2 в мазках из носа, рта, горла или в жидкости из легких. Если генетический материал вируса обнаружен, фермент CRISPR генерирует флуоресцентное свечение. По данным компании, результаты теста можно получить примерно за час.

Исследователи во главе с Чжаном и биоинженером Джеймсом Коллинзом из Массачусетского технологического института впервые описали принципы работы теста в 2017 году [1]. В 2018-м команда, куда входили некоторые из этих ученых, показала, что тест может обнаружить низкие уровни вируса Зика и денге [2].

Другие лаборатории также разрабатывают диагностические тесты SARS-CoV-2 на основе CRISPR. В прошлом месяце исследователи из Сан-Франциско, Калифорния, опубликовали подробности о тесте, который может дать результаты примерно через 40 минут [3]. Подобный подход описали в препринте ученые из Аргентины и Калифорнии [4].

Глава Sherlock Bioscience Рахул Дханда говорит, что сейчас компания работает над созданием одноразового модуля, который не нужно будет обрабатывать в лаборатории и можно будет использовать дома. Но, по его словам, такой тест потребует дополнительных проверок, и на него нужно будет получать отдельное разрешение FDA.

С начала апреля агентство выдало разрешения на использование в экстренных ситуациях более 60 диагностических тестов на SARS-CoV-2. Однако ни один из этих тестов не разрешено использовать и обрабатывать в домашних условиях.

1. Gootenberg, J. S. et al. Nucleic acid detection with CRISPR-Cas13a/C2c2. Science 356, 438–442 (2017).
2. Myhrvold, C. et al. Field-deployable viral diagnostics using CRISPR-Cas13. Science 360, 444–448 (2018).
3. Broughton, J. P. et al. CRISPR–Cas12-based detection of SARS-CoV-2. Nature Biotechnology(2020).
4. Curti, L. et al. An ultrasensitive, rapid, and portable coronavirus SARS-CoV-2 sequence detection method based on CRISPR-Cas12. Preprint at bioRxiv (2020).